知网论文查重系统对论文引用的合理判定是根据其相似度和原创性来进行评定的。系统会对论文中的引用进行比对，若引用内容过于相似或与其他已发表的文献雷同度较高，则可能被视为抄袭。然而，并非所有相似度高的引用都属于抄袭，有些引用可能是因为所研究的主题或领域限制造成的。因此，在使用知网论文查重系统时，需要综合考虑引用内容的相似度、原创性以及上下文的合理性。

为了合理使用知网论文查重系统进行论文查重，作者应该在写作过程中注重引用的规范性和合理性，避免出现过于相似或雷同的引用内容。在引用他人观点或研究成果时，应该注明出处，并确保引用内容与自己的研究课题相关。此外，作者还可以通过调整引用内容的表达方式或增加自己的观点来提高论文的原创性，从而降低被系统判定为抄袭的风险。